C3 畢加索的安全配置較為豐富。

在被動安全方面，前排座椅配備安全帶預緊裝置（雙預緊）和負荷限制器，駕駛員和副駕駛前部安全氣囊為單階，還有側面身體安全氣囊和側面頭部安全氣囊。

在碰撞測試中，正面碰撞時對乘客膝蓋和臀部保護良好，但方向盤碰撞到駕駛員胸部；側面壁碰撞表現出眾，側面桿碰撞中胸部保護一般，后追尾碰撞對頸椎保護差。兒童乘坐者碰撞保護方面，對 3 歲孩童保護獲高評級，1 歲半孩童正向放置比后向放置保護好，副駕駛正面安全氣囊可關閉以安放兒童座椅，但缺少清晰的安全氣囊工作狀態標識。行人碰撞保護方面，保險杠對行人保護得滿分，發動機蓋前緣大部分區域對行人頭部保護較差。

在主動安全方面，部分車型將電子穩定控制系統（ESC）作為標配，未標配 ESC 安全系統的車型不在歐洲 NCAP 考核范圍，同時駕駛員自設定限速裝置大多為標配，未配備的車型用戶可選配。此外，所有車型配置駕駛員位置的安全帶提醒，副駕位置及后排乘客的安全帶提醒為選配裝置。