奧迪 A6 的變速箱類型較為豐富。

常見的有以下幾種：

- 濕式雙離合變速箱：如 7 擋濕式雙離合，采用一大一小共兩組同軸安裝在一起的多片式離合器，被安裝在充滿液壓油的密閉油腔里，具有良好的調節能力和較高的熱熔性，能傳遞較大扭矩。

- 六擋手動變速箱：通過不同的齒輪組合產生變速變矩。

- 七檔 CVT 變速箱：由奧迪與德國汽車零部件巨頭 LuK 合作開發，具有較好的傳動平穩性。

- 六擋手自一體變速箱：集合了手動和自動變速箱的優點。

- 01V 自動變速器：由 ZF 公司提供，大量配備在奧迪 A6 等車型上。

- 6HP-26 和 6HP-19A 自動變速器：分別配備在奧迪 A8 和 05 款奧迪 A6L 上，機械結構、功能和控制方面基本相同，傳遞轉矩有所不同。

- 4HP-18 自動變速器：早期生產的奧迪轎車有裝用。