企業申請北京新能源指標的特殊要求包括：

企業需具有統一社會信用代碼的有效營業執照。注冊資金不少于 5000 萬元，公司名稱中不含有區域名稱，公司經營范圍包含新能源相關業務。

企業上一年度或當年在本市必須繳納入庫增值稅額 5 萬元（含）以上。對于注冊地在本市的制造業企業、信息傳輸、軟件和信息技術服務業企業，除上述條件外，還需滿足上一年度在本市完成固定資產投資額 1000 萬元（含）以上的要求。非全額撥款事業單位、社會團體及其他組織也需具有統一社會信用代碼的有效登記證書。

企業當年可以申請 1 個車牌指標，每增加 50 萬元可以增加申請 1 個指標，但年度申請指標數量上限不得超過 12 個。在上限范圍內，可以全部申請新能源小客車指標，普通小客車指標申請數量不得超過 6 個。

申請流程：

準備材料，如營業執照、組織機構代碼證、稅務登記證、車輛購置稅完稅證明、車輛合格證、車輛銷售發票、駕駛證等。在北京市交通管理局網站提交申請，等待審核。審核通過后，前往北京市交通管理局辦理牌照手續并領取車牌。

申請建議：

提前規劃時間，以免錯過申請截止日期。了解北京市交通管理局的相關政策，例如尾號限行、外地車輛進京等。選擇符合北京市交通管理局相關標準的新能源車型。購買交通事故責任強制保險和商業險，保障車輛安全。