C1 開摩托車扣 9 分和 12 分的區別在于，通常情況下是扣 9 分。

但如果存在一些嚴重的違規行為，比如逆行、酒駕、超速、闖紅燈、駕駛與準駕車型不符等，就會被扣除 12 分。

而且，根據最新規定，C1 駕照只能開小型、微型載客汽車等車輛，摩托車不在其準駕范圍內。若被查到用 C1 駕照開摩托車，會扣 9 分，還可能面臨 200 元至 2000 元的罰款。

C1 駕照持有者若想駕駛摩托車，可選擇增駕摩托車駕照。增駕成功后，兩份駕照合并在一個本子里，分數共用，共 12 分。

需要注意的是，增駕有條件限制，C1 駕照持有者在實習期滿后且一個記分周期內未累積超過 12 分的交通違規行為才有資格參加增駕考試。在 C1 駕照實習期內，若發生違規行為并被記分超過 12 分，則無法參加增駕考試。

所以，C1 駕照持有者要嚴格遵守交通規則，了解準駕車型，避免扣分和相關處罰。