網上注銷車輛和線下注銷車輛在多個方面存在區別。

首先是準備的材料，線下需準備摩托車行駛證、車輛登記證書、車主身份證等，因車輛滅失申請注銷還得有相關部門出具的滅失證明。網上注銷也需這些基本材料，但通常是拍照上傳。

接著看辦理方式，線下辦理能直接和工作人員溝通，問題解決及時，審核速度相對較快，但得親自去車管所，可能要花時間排隊。網上辦理方便快捷，不用出門，能隨時查看進度，不過對網絡和設備有要求，可能因上傳資料不清晰審核不通過。

還有法律效力，網上和線下注銷證明都具有同等效力。

對于車主的影響，從法律層面，完成注銷能避免未注銷帶來的法律責任。想要買新車的，完成注銷能保證新車順利上牌登記。

此外，注銷也有助于規范交通管理秩序，保障道路交通安全。

總之，無論選擇哪種方式，都應按規定及時辦理注銷，保障自身合法權益。