新款馬自達 5 在安全配置方面有諸多改進。

首先，不分車款均擁有前座雙安全氣囊、ABS 防死鎖剎車系統、EBD 電子剎車分配力道、BAS 剎車輔助系統等標準配備。

馬自達 5 更將 6 SRS 氣囊列為全車系標配，在國產同級車里樹立了全新的安全標桿。

在結構設計上煞費苦心，MAIDAS 3H 高剛性車體，在引擎蓋部分增加了行人沖擊的緩沖空間，車門也針對防撞鋼梁剛性進行加強。

主動安全方面，ABS+EBD+BAS 三合一剎車輔助系統與倒車輔助雷達皆是全車系標配。

頂級影音旗艦車型還加入 DSC 車身動態穩定系統與 TCS 循跡控制系統，能有效提升車輛操控穩定性。

歐洲 NCAP 碰撞測試顯示，馬自達 5 對駕駛員及副駕駛員的頭部及頸部保護優秀，胸部、大腿和腳部在正面碰撞中達到安全標準，側面保護更是出色。