辦理上海留學生免稅車手續主要有以下步驟：

1. 申請：準備好身份證、護照、戶口戶主頁＋本人頁、入學通知書、畢業證原件、電子出入境記錄、境外學歷證明、中國駐外使領館開具的《留學回國人員證明》、填寫的入關旅客行李物品申報單以及本人購車申請表一式四聯（海關處索取）。上海地區留學回國人員可直接向上海海關提出申請，外省市留學回國人員須持當地海關核準簽發的《購車準購單》關封及上述證明至上海海關業務二處審核并調換關封。

2. 報關：準備好身份證、護照、戶口戶主頁＋本人頁、入學通知書、畢業證原件、電子出入境記錄等文件后，前往上海黃浦海關審核。海關返還的需要郵寄的材料要當天郵寄出去。

3. 付款：如果選擇的車輛沒有現車，需要等待車輛生產好下線。廠家給出賬號后完成車輛付款。

4. 提車：廠家發車后，車子到店，約好時間由相關工作人員協助辦理提車事宜。他們會幫忙驗車、上保險、辦理臨時牌照，并叮囑相關材料事宜。

5. 上牌：先上上海臨時車牌，后續選號上牌過程中遇到問題可隨時咨詢。

需要注意的是，留學生向海關申請需要留學證明，這是中國駐外使領館給留學生出具的，很多留學生因不了解政策，在國外時未到使領館辦理，導致回國后無法申請。海關對申請的時間有限制，留學生要在畢業后兩年之內回國，在回國一年之內向海關申請，這兩個時間必須同時滿足，否則其資格自動失效。而且留學生要在廠家買車，在代理商購買是不能享受這項政策的。此外，僅限海關歸國留學生免稅車目錄的車輛適用免稅政策，上牌前可憑海關核準的留學生購車準購單及購車發票到當地公路工程管理部門領取免繳車輛購置附加稅憑證。