違反校車安全管理條例會受到多種處罰。

校車駕駛人如有駕駛校車運載學生不按照規定放置校車標牌、開啟校車標志燈，不按確定線路行駛，上下學生不按停靠點停靠，未運載學生卻使用相關標志，駕駛前未檢查車況或駕駛有隱患校車，在校車載有學生時加油，發動機未熄火就離開駕駛座位等情形，由公安機關交通管理部門責令改正，并處 200 元罰款。

校車超載的，超過核定人數未達 20%，處 500 元罰款；超過 20%以上的，處 2000 元罰款，扣留車輛，駕駛人記 12 分。

駕駛人未取得校車駕駛資格駕駛校車，處 1000 - 3000 元罰款，吊銷駕駛證，扣留駕駛證，記 12 分。

車輛所有人使用拼裝、報廢標準的機動車接送學生，分別處 80000 - 100000 元罰款。使用未取得校車標牌的車輛提供校車服務，處 10000 - 20000 元罰款，扣留車輛。

未按照規定指派照管人員隨校車全程照管乘車學生，處 500 元罰款。

取得校車使用許可的學校、校車服務提供者違規情節嚴重，地方人民政府可吊銷其許可，收回校車標牌。

學校違規，會被通報批評，導致學生傷亡事故的，公辦學校相關責任人員會被處分，民辦學校可能被責令暫停招生，嚴重的吊銷辦學許可證，相關責任人員 5 年內不得從事學校管理事務。

另外，路遇校車不禮讓的，會被記 3 分、罰款 200 元。