新能源車船稅與傳統燃油車在多個方面存在區別。在購置稅上，新能源車免征，傳統燃油車需繳納；車船稅方面，多數新能源車免費，傳統燃油車按排量和地區定價。其他稅費上，新能源車交稅也明顯少于燃油車。納稅義務人、義務時間與期限、納稅地點等規定也各有不同。這些差異體現了政策對新能源汽車的支持，旨在推動綠色出行與汽車產業的轉型發展 。

從納稅義務人角度來看，車輛購置稅的納稅義務人是在境內購置汽車等的單位和個人，而車船稅的納稅義務人則是境內規定車輛、船舶的所有人或管理人，二者概念不同。

納稅義務時間與期限同樣有別。車輛購置稅納稅義務發生時間為購置應稅車輛當日，應自發生之日起六十日內申報繳納，且要在辦理車輛注冊登記前繳納，遵循一車一申報原則；車船稅納稅義務發生時間為取得車船所有權或管理權當月，按年申報，分月計算，一次性繳納，納稅年度為 1 月 1 日至 12 月 31 日。

納稅地點也存在差異。車輛購置稅需辦理登記的要向車輛登記地主管稅務機關申報，不需辦理的單位納稅人向機構所在地申報，個人納稅人向戶籍或經常居住地申報；車船稅納稅地點為車船登記地或扣繳義務人所在地，無需登記的車船納稅地點為所有人或管理人所在地，已代收代繳的不再向車輛登記地主管稅務機關申報 。

自 2024 年 7 月 1 日起，享受車船稅優惠的新能源車有了新的技術標準，比如插電式（含增程式）混合動力乘用車純電動續駛里程有條件的等效全電里程不低于 43 公里等。這也在不斷推動新能源汽車技術的進步。

總之，新能源車船稅與傳統燃油車船稅在諸多方面的區別顯著，這些區別不僅反映了政策導向，也對消費者的購車選擇和用車成本產生影響，更在宏觀層面推動著汽車行業朝著綠色、環保、創新的方向發展。