奔馳 CLK GTR 的制動系統具有出色的性能。

其制動系統能應對車輛較大的整備質量，幾次測試剎車距離均未超過 38 米，最好成績為 36.66 米，平均 36.99 米，讓同級車型望塵莫及。

奔馳制動向來出色，這得益于其精心設計。

一些車型的制動卡鉗采用鋁合金整體加工，徑向配置四活塞和六活塞，減輕非懸掛質量，改善車輛動態效果和性能。

制動設備包含兩件式浮動制動盤，減輕懸掛質量并加快散熱。

此外，浮動式制動盤的抗噪聲硬件源自 F1 賽車制動件設計經驗。制動盤尺寸多樣，直徑從 345 毫米到 405 毫米，厚度從 28 毫米到 34 毫米。

對于追求更完美制動效果的車主，還可選擇改裝如 Brembo GT-R 超強性能制動剎車套裝，進一步提升制動性能。