配汽車鑰匙一般不會影響車輛安全，但前提是要通過合法且專業的途徑進行操作。

如果是非法或非專業人員操作，可能會出現一系列問題。比如，非法配制的鑰匙可能沒有安全芯片或芯片未被正確激活，導致車輛防盜系統失效，增加被盜風險。而且非法配制的鑰匙可能無法使用車輛的某些高級功能，還可能損壞車輛電子系統，影響正常運行。非法配制鑰匙不僅違法，若因鑰匙問題導致車輛被盜或其他損失，還需承擔法律責任。

現在的電子車鑰匙工作原理是，車子門鎖時刻發射射頻信號，車鑰匙傳感器接收后發送到芯片，對碼成功后鑰匙向車子發送密碼信號，車子解密并回傳信號，處于準開鎖狀態，車主按下開門按鈕即可開門。啟動發動機原理類似。

如果有一種設備能截取并破解車子信號，就能制造出能啟動汽車的“副廠鑰匙”。

在汽配城配鑰匙，要注意店家是否有公安的“備案許可”證書，若鑰匙丟在常用地址附近，建議盡早去配或刪除丟失鑰匙。配新鑰匙時要告知店家已丟失的情況，開車去讓其用設備刪除，丟失的鑰匙芯片和遙控器會失效，機械鑰匙雖能開車門，但汽車感應不到芯片無法啟動。實在不放心可改機械鎖齒或換門鎖。

車鑰匙配對通常要通過專業汽車服務站或授權經銷商進行。首先，技術人員會用專用診斷工具連接車輛電子控制單元，確保車輛系統正常，然后輸入安全碼或車輛識別號碼，按指南啟動配對程序，最后測試新鑰匙功能。

配對時要選擇正規渠道，保護個人信息，備份鑰匙，定期更新。配汽車鑰匙存在信息泄露、技術、經濟、法律、車輛安全、個人隱私、車輛性能、設備損壞等風險。為降低風險，應選擇正規有資質的配鑰匙店鋪或人員，配前了解流程和費用，確保操作人員熟悉流程規范，配后檢查車輛，定期檢查設備。