自行維修柴油機存在不少風險。

首先是三濾問題，自行維修時對零件拆卸安裝要嚴格遵循規程，亂打亂敲易致零件變形。零部件組裝前務必清潔干凈，防雜質混入，否則會漏油且影響發動機工作。出油閥與閥座接觸環帶處極小雜物都能引發漏油。要研磨或銑削零件結合面，保證其光潔度和精度，實現密封。空氣濾清器狀態差會讓灰塵進氣缸，導致活塞環等部件早期磨損，啟動困難，功率下降。柴油、機油濾清器不佳，雜質會使精密偶件早期磨損，甚至讓柴油機早期報廢。

其次是柴油霧化關，柱塞副、出油閥副及噴油器針閥副技術狀態不好會造成噴油霧化不良，導致發電機啟動難、燃燒不完全、積炭增多，發動機功率下降、油耗增加，所以要認真檢查燃油系。

再者是正時關，包括供油正時和配氣正時。供油不正時，S195、X195 型柴油機可借助噴油泵與齒輪室蓋間的墊片調整。配氣不足時先檢查正時齒輪安裝誤差，再調氣門間隙，要注意活塞壓縮到上止點時，進、排氣門間隙不能小于 0.2mm。

還有高壓共軌油管拆不得，發動機工作時切忌拆卸高壓側油管接頭，如共軌油管。因其壓力超高，拆卸時高速噴射燃油會產生高壓液體切割效果，危險極大，應在發動機熄火并泄壓后再拆卸檢修。

自行維修還可能在處理電控柴油發動機問題時，未清零存儲的故障碼，造成混淆判斷。新修復的發動機可能因 ECU 記錄的故障碼使儀表盤警告燈亮起。減壓閥裝置不能隨意拆卸，磁性螺塞不能隨意替代。

另外，自行維修柴油機時，要嚴格要求零件拆卸安裝，組裝前清潔干凈，局部抹石棉油，研磨零件結合面。還要注意檢查散熱器空氣流量、車軸轉動、發動機風扇皮帶、外部空氣溫度等，避免負載下發動機過熱。解決柴油機啟動問題，要檢查燃油供應、蓄電池和起動機連接、起動馬達、燃油泵和管路、燃油是否被污染、空氣濾清器等。